Primeiro desmonte o USB, digite no terminal:
sudo umount /dev/YOUR_USB
Onde YOUR_USB
é o Sistema de Arquivos, para obtê-lo Digite o Terminal:
df
Ou
df /path/to/your/usb
Após o umount
, você deve conseguir formatar o USB usando o GParted.
Aqui está um exemplo:
$ df /media/bg/120GB/
Filesystem 1K-blocks Used Available Use% Mounted on
/dev/sdb1 115247656 22539168 86831140 21% /media/bg/120GB
$ sudo umount /dev/sdb1