Sugiro que você adicione a linha desejada em /etc/rc.local:
gksudo gedit /etc/rc.local
Use nano ou kate ou leafpad se você não tiver o editor de texto gedit. Adicione uma única linha logo acima da saída 0:
ethtool -s eth0 autoneg off speed 100
Revise cuidadosamente, salve e feche o editor de texto. Você deveria estar tudo pronto.