Instale o pacote vegan para R via terminal

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Oi eu quero instalar o pacote vegan para R via terminal - até agora eu tenho isso:

Isso faz o download do arquivo compactado necessário ( esta parte funciona )

wget -O ~/file/downloads/vegan_2.3-5.tar.gz "http://download.r-forge.r-project.org/src/contrib/vegan_2.3-5.tar.gz"  

Eu quero que isso instale esse pacote para que eu possa executá-lo em R ( esta parte não funciona mensagem de erro: erro de sintaxe perto de token inesperado '(' )

install.packages(~/file/downloads/vegan_2.3-5.tar.gz, repos = NULL, type="source")  

Obrigado antecipadamente

    
por Giles 28.05.2016 / 20:19

1 resposta

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Ok, eu tenho a resposta, obrigado rcs pelo método de instalação. Basicamente vegan requer instalação anterior de permute . Então esses comandos fazem o truque:

wget -O ~/downloads/permute_0.8-3.tar.gz "http://download.r-forge.r-project.org/src/contrib/permute_0.8-3.tar.gz"
wget -O ~/downloads/vegan_2.3-5.tar.gz "http://download.r-forge.r-project.org/src/contrib/vegan_2.3-5.tar.gz"
sudo R CMD INSTALL ~/downloads/permute_0.8-3.tar.gz
sudo R CMD INSTALL ~/downloads/vegan_2.3-5.tar.gz
    
por Giles 28.05.2016 / 22:42