se você executar o 'netstat' como superusuário:
sudo netstat -tulpn | grep 80
Isso deve mostrar o processo que está usando a porta 80, que pode ajudá-lo. Sem mais informações, parece que talvez o Gitlab já esteja usando a porta 80, na minha instalação do Gitlab, ele usa o nginx na porta 80 por padrão.
Você talvez fez uma reinstalação do Gitlab em algum momento? Olhando para o arquivo 'gitlab.conf.bac' em sua saída do grep e eu diria que você instalou o Gitlab usando o Apache primeiro e então talvez tenha feito uma reinstalação usando o nginx?
Então, verifique o netstat como sudo e acho que essa será sua resposta.