Ok, aqui vai: Como fazer o backup da sua pasta pessoal tudo bem e salvo. Então, sua pasta pessoal está sempre localizada em
/home/yourusername
O que você vai querer fazer é exatamente isso:
cp -R /home/yourusername /your/target/goes/here
O -R aqui diz ao comando cp para ser recursivo. Ele irá copiar a pasta em si e as subpastas. Isso fará o backup de sua pasta inteira.