Se eu estou entendendo sua pergunta, para inicializar o seu "segundo" sistema operacional, sempre que o computador inicializar você precisa ir para o menu de inicialização, eu nunca tive um computador que foi automaticamente para o menu de inicialização então você tem que pedir para fazer isso.
Quando o computador é iniciado, ele deve ter uma mensagem na tela indicando qual tecla F deve ir para o menu de inicialização. F12 é bastante comum eu acredito. Depois de entrar no menu de inicialização, selecione o disco rígido no qual seu sistema operacional está ligado e, em seguida, uma lista dos sistemas operacionais disponíveis deve aparecer, selecione o que você quer e você deve estar pronto.