O processo de instalação não solicitará a senha raiz nem a senha do usuário pessoal, mas a senha do usuário do banco de dados root. Isto é, se você não mudou, inicialmente vazio.
Você deve correr
mysql_secure_installation
e defina uma senha root do mysql quando solicitado. Em seguida, reinicie a instalação do phpmyadmin com a agora bem conhecida senha de root do mysql.