Adriano,
Da saída lsusb
que você postou, parece que o seu lado do Linux não está reconhecendo o seu hub USB como dois dispositivos diferentes. Em vez de ter um hub USB 2.0 e um hub USB 3.0, ele mostra o mesmo hub USB 2.0 duas vezes (eles têm IDs idênticos).
Por exemplo, no meu sistema lsusb
me dá o seguinte:
Bus 002 Device 001: ID 1d6b:0003 Linux Foundation 3.0 root hub
Bus 001 Device 001: ID 1d6b:0002 Linux Foundation 2.0 root hub
...
Observe que há um hub 2.0 e um 3.0 com IDs exclusivos. Minha sugestão seria executar sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade
para atualizar seu sistema. Se isso não funcionar, verifique as configurações do BIOS do seu computador para ver se XHCI_Hand_off está habilitado. Caso contrário, vá pesquisar AQUI para obter drivers compatíveis.
Boa sorte!