Este problema pode ser causado por causa de algum aplicativo que você está executando pode ser um monothread aplicações, portanto, eles vão usar e max fora único núcleo de sua CPU.
Você poderia postar TOP
resultado?
Você sempre pode reatribuir o processo ao outro núcleo da cpu usando
taskset -c 0 application
Isso pode ajudar a verificar se você pode usar outros núcleos de CPU com outros aplicativos.
Para obter informações mais precisas em tempo real sobre o que está acontecendo Você pode fazer o download de htop
package
sudo apt-get install htop
htop