Eu tenho um problema semelhante. Abra alsamixer
via Terminal e confira a coluna de fones de ouvido. Se estiver em 0, aumente o volume. Pelo menos no meu caso, toda vez que eu fizer login no meu som da conta do Xubuntu não sai, embora o Master esteja acima de zero e eu tenha que configurar um valor Headphones mais alto manualmente. Espero que seja apenas um bug temporário que será corrigido em breve.