Eu não posso te contar o que é melhor para você, mas vou te contar o que eu fiz em nossos servidores internos.
Eu sempre instalei servidores Ubuntu ou Debian em raid de software Linux. Eu já tive que recuperar uma unidade quebrada e isso foi muito fácil de fazer. também o sistema apenas inicializaria com apenas um drive ativo. Apenas hotswap e adicioná-lo ao volume lvm againe.
O que eu não faria é executar o seu sistema operacional do SSD, mas dos dois discos. Se o seu SSD falhar, você perderá todo o seu sistema operacional se um dos discos falhar e você apenas pedir um novo e ainda está ok.
para configurar isso eu usei este guia no passado com sucesso. link
Você pode até mesmo fazer coisas exóticas e usar o raid 1 para dados e os e usar raid 0 para swap