Isso significa que você instala o meta-pacote do kernel manualmente por
sudo apt-get install linux-generic-lts-vivid
Mas você ainda tem meta pacotes para o kernel 3.16, que são lts-utopic
.
Você pode remover todos os kernels 3.16 usando o Synaptic e os pacotes meta também serão removidos.
Alternativamente, você pode remover apenas pacotes meta e deixar os kernels instalados.
sudo apt-get remove linux-image-generic-lts-utopic linux-headers-generic-lts-utopic