Primeiro, eu suponho que você esteja falando de DEs (ambientes de desktop) e não gerenciador de janelas, já que o MATE é um ambiente de área de trabalho completo e não um gerenciador de janelas. uma maneira simples: o gerenciador de janelas é responsável apenas pelos quadros em torno de seus aplicativos ... como Compiz, Metacity, Marco, etc.)
como você apontou, você precisa de um ARM-build para um CPU ARM, x86-build para um processador de 32 bits e assim por diante ...
comum um SBC (placa única conmputer) não tem "poder gráfico" suficiente para executar um DE que precisa de aceleração 3D como Unity (o padrão do Ubuntu) ou GNOME 3.x.
com certeza sua placa ARM pode ter energia suficiente para rodar um sistema ubuntu (então existe a possibilidade de fornecer um build MATE) , mas isso não tem que significar também o padrão ou qualquer outro ambiente de desktop gráfico empacotado!
talvez eu esteja errado e você possa tentar instalar a unidade depois com o comando sudo apt-get install unity , mas tenho certeza que isso não funcionará e você vai atrapalhar o seu sistema.
primeiro faça backup do seu arquivos e esperar que você tenha que reinstalar o Ubuntu! - não me culpe que eu não te avisei!