Isto parece ser dependente do tema GTK2 escolhido.
Não tenho certeza se planejado dessa forma ou é um bug, mas parece que algumas cores são difíceis de definir usando o Breeze como tema GTK2.
Se você for para:
Settings -> Application Style -> GNOME Application Style (GTK)
e mude o tema em 'selecione um tema GTK2' suas cores podem funcionar melhor em um tema diferente.