Existem muitos programas que analisam o arquivo de saída de Gaussian (MacMolPlt, Gabedit, Avogadro). Entre eles, Molden é a melhor alternativa que eu conheço: link Porque é fácil de usar e inclui muitos recursos como: visualização de vibrações moleculares, isosuperfícies ou curvas de contorno de orbitais moleculares, densidades eletrônicas, diferenças de densidades; também, permite o cálculo do potencial eletrostático, a função de localização eletrônica (ELF), gera o arquivo wfn (arquivo de entrada para cálculos QTAIM feitos com programas como AIMALL, MULTIWFN), realiza cálculos de mecânica molecular, etc.