Talvez uma pista sobre o tipo de aplicativo que você tinha em mente pudesse esclarecer - se você copiar seu aplicativo, chamá-lo "app", para a partição e digitar (em um console, obviamente) /mnt/ramdisk/app então ele executará essa cópia específica.
Se você tiver problemas para fazer isso, provavelmente significa que você tem um sistema de segurança que proíbe você de fazer isso - existem vários, então será necessário um pouco mais de detalhes na questão! Além disso, verifique se as permissões para ele têm 'x' definido (se você fizer ls -l ). Se não, chmod +x app consertará isso.
Normalmente, seu sistema examina a variável $ PATH para decidir qual cópia será executada; which app dirá qual delas planejava usar, echo $PATH explicará porque escolheu esse.
Lembre-se, para o benchmarking, que app pode escolher usar um diretório diferente para dados - depende do que é, é claro. Além disso, os sistemas de multitarefa não se prestam facilmente ao benchmarking simples - pelo menos, várias execuções.