A Remastersys vem criando arquivos ISO excepcionalmente pequenos, observei esse problema a partir do Ubuntu 14.10, mas isso também acontece em 15.04, 15.10 e até mesmo nas compilações diárias de 16.04 LTS. Este fórum (que eu tenho 99% de certeza que é problema meu) aqui sugere como consertar o problema, mas Eu não sei como instalar os pacotes syslinux-utils e isolinux no ISO manualmente, então como faço isso? Eu usaria Systemback, mas eu não quero fazer backup de todo o meu sistema e compactá-lo em um ISO. Eu só quero criar uma distribuição personalizada para usar em casa e compartilhar com meus amigos.
OK, então eu descobri que você precisa instalar os pacotes syslinux-utils e isolinux no sistema principal e não no ISO. Por alguma razão, ao instalar o Remastersys, esses dois pacotes não são instalados, mas é necessário se você quiser que o Remastersys faça arquivos ISO totalmente funcionais.