Vá para o Terminal e execute este comando
click info com.canonical.elpais
e veja qual versão você tem. Então,
click register com.canonical.elpais <version>
substitua <version>
pelo seu.
Ele deve funcionar, já que você não o removeu do sistema pré-instalado (você pode encontrá-lo em /custom/click/com.canonical.scopes.elpais).
Informações sobre o comando de clique: link