O ambiente de área de trabalho do GNOME oculta ícones da área de trabalho por padrão. Se você quiser que eles apareçam, abra o GNOME tweak-tool
na guia Desktop
set Icons on Desktop
to ON
.
Se você não tem o GNOME tweak-tool
você pode instalá-lo usando o comando sudo apt-get install gnome-tweak-tool
ou procurar por ele no Ubuntu Software Center.