Isso ocorre porque o ISO continha uma tabela de partições, que substituiu a da unidade flash. Para corrigir isso, crie uma nova tabela de partições na unidade.
No GParted, você pode encontrar isso em Dispositivo → Criar tabela de partições . Selecione uma tabela de partições msdos
.
Verifique se você está realmente operando na unidade correta, senão você pode acabar com um computador sem inicialização.