Isso pode ser devido à porta que você está usando. Ouvi dizer que algumas portas devem ser reservadas para teclado / mouse. Se você usar uma porta diferente, como a da parte de trás, em vez da frente), isso pode ajudar. Eu sei que o Windows tem problemas se eu mudar o mouse para outra porta enquanto ele é executado. e se eu mudar para outra porta, ela pode não ser detectada quando o Windows iniciar, embora o Ubuntu não detecte problemas.
BTW: tente evitar hubs para teclado e mouse.