Você pode tentar o comando abaixo e tentar remover o usuário:
sudo umount /run/user/root/gvfs
Eu criei um usuário do sistema usando este comando
sudo adduser --system --home=/opt/odoo --group odoo
e quando tentei removê-lo mais tarde usando este comando
userdel -r odoo
recebi este erro
userdel: error removing directory /opt/odoo
quando tentei removê-lo manualmente sudo rm -rvf /opt/odoo
recebi este
rm: cannot remove ‘/opt/odoo/.gvfs’: Device or resource busy
Você pode tentar o comando abaixo e tentar remover o usuário:
sudo umount /run/user/root/gvfs