Esse problema não tem nada a ver com o alinhamento da partição (embora também possa haver problemas de alinhamento). Basicamente, o problema é que duas partições primárias ( /dev/sda2 e /dev/sda3 ) residem dentro da partição estendida ( /dev/sda4 ). Isso é ilegal. Esse problema pode ser corrigido pelo meu programa FixParts , que faz parte do pacote Ubuntu gdisk ; mas a identificação adequada do que cada uma dessas partições faz é necessária antes de prosseguir. Em particular, as partições de inicialização não devem se tornar partições lógicas.