Você pode tentar o seguinte.
1) Inicialize seu computador a partir do pendrive USB e copie arquivos importantes para você no disco rígido externo.
2) Se você ver que o acesso aos seus arquivos é negado quando você inicializa a partir de USB ou CD (geralmente acontece), leve seu HDD para qualquer HDD e copie os arquivos importantes para outro computador.
3) Se você quiser copiar qualquer coisa das partições ext4, outro computador deve rodar o Linux. Existem também algumas ferramentas para ler partições ext4 do Windows 8x, você pode usá-las se estiver confortável com elas.
4) Instale o Windows 8.1 (não 10 !!!) primeiro. Não aceite nenhuma opção para atualizar para o Windows 10, pois esse sistema tem alguns comportamentos imprevisíveis. Escolha instalação limpa e apague completamente este disco rígido. Não tente manter seu sistema operacional e seus dados antigos, isso criará uma bagunça. Se você não quiser mais dual boot, pule esta etapa.
5) Instale o Ubuntu em qualquer disco rígido separado. Escolha instalação limpa e apague completamente este disco rígido. Não tente manter seu sistema operacional e seus dados antigos, isso criará uma bagunça.
6) Execute o sudo update-grub no terminal, se você instalou o Windows e deseja sua reinicialização dupla.