Após algumas investigações, encontrei o seguinte:
Mesmo que você não permita que o Skype ajuste automaticamente o nível de som, o Skype ajusta o nível do microfone para zero, independentemente de ser um microfone interno ou externo.
Pegue um mixer de som, como veromix
. Divida o som proveniente do microfone no canal direito e esquerdo, desbloqueando o ajuste do nível de som. Em seguida, ajuste o canal direito para zero e o canal esquerdo para o máximo. Depois disso, você pode travar o ajuste de nível novamente, a posição do ajuste de nível é de cerca de 50%.
Depois disso, o microfone no Skype funcionará normalmente.
Não modifique o nível de som para entrada, por ex. em pulseaudio
, ele lhe dará a situação antiga sem o som do microfone. Este ajuste permanecerá também após o reinício.