Uma possibilidade é que algum arquivo excluído ainda esteja sendo gravado e esteja sendo expandido:
Eu tenho experimentado um problema enorme com o meu sistema recentemente, onde algo desconhecido está comendo todo o meu espaço disponível na raiz do fs. Mesmo se eu deletar arquivos, ele estará quase instantaneamente de volta a "0 bytes disponíveis" novamente (como reportado pelo Gnome).
Executando o Disk Usage Analyzer, parece que o problema está dentro de ~. Por exemplo, eu tinha mais de 6GB livres na raiz fs. O Disk Analyzer mostra ~ como 5.7GB, mas o maior arquivo dentro de ~ é de apenas 175MB e tudo o que foi adicionado não seria igual a 200MB no total. Então, o que está ocupando esse espaço fantasma? Uma corrida de "du -h" lista os arquivos pequenos e, em seguida, simplesmente "." com um tamanho de 5.8GB! Eu não sei o que é isso, ou se é seguro deletá-lo (se é que isso é possível).
Estou executando este sistema sem problemas há algum tempo, até que isso começou a aparecer. Sem espaço em disco disponível, não consigo iniciar aplicativos e o Gnome está completamente confuso na reinicialização - ele não será iniciado devido à falta de espaço.
Em um problema diferente, embora possivelmente relacionado, também tenho outra partição de dados EXT4, na qual o Gnome e o sistema também estão listados como tendo "0 bytes" de espaço livre, mas sei que isso está incorreto. O GParted reporta 33 GB grátis. Isso não é um problema tão grande porque não afeta a partição raiz e a usabilidade do sistema, mas eu pensei em mencioná-lo, pois ele pode estar relacionado e precisa ser corrigido também.
Obrigado por qualquer ajuda!
Uma possibilidade é que algum arquivo excluído ainda esteja sendo gravado e esteja sendo expandido: