Este erro às vezes existe se você atualizar via GUI. Tente atualizar a partir da linha de comando.
sudo apt-get update ; sudo apt-get upgrade
Se isso não ajudar, tente liberar espaço. Desinstalar os kernels antigos do linux me ajuda.
sudo dpkg -l | grep linux
Em seguida, desinstale os kernels antigos. Se você tiver apenas um, não o desinstale!