Eu tenho o mesmo problema. O motivo:
Eu tenho um laptop muito antigo e, quando minha bateria e carga de laptop r quebrou, comprei "genéricos" no ebay e não no original da Lenovo. A bateria não cria problemas, mas quando o carregador genérico está conectado, tenho os mesmos problemas. No Windows acontece o que você descreve, mas no Ubuntu 14.04 (dual boot) eu não posso nem mover o cursor ...
Use um mouse externo ou desconecte o carregador e veja se os problemas desaparecem.
Talvez você tenha o mesmo problema.