Sua versão do OpenCV não possui ligações Java, elas estão disponíveis a partir da versão 2.4.4 - as ligações Java não costumavam ser incluídas por padrão no OpenCV, mas agora suporta ligações Java; - anúncio .
procurando pelo pacote opencv com
apt-cache search opencv
eu encontrei
libcv2.4
e a ligação pyton
python-opencv
Você conhece um pacote de ligação java?