Hmm depois de um dia, acho que corrijo o problema, e estava no espaçamento no arquivo '/etc/bind/zones/rubyonerails.com.db'.
Como eu tento muitas soluções eu copiei o conteúdo do bloco de notas para este arquivo e todas as linhas foram movidas para a direita por um espaço TAB. (eu removi o espaço TAB para todas as linhas do lado esquerdo)
Agora eu reiniciei o bind9 e tudo ficou bem. Meu domínio aponta para meu DNS personalizado.
Eu não tenho certeza se essa é uma solução 100%, talvez os caras da servermania hosting tenham feito algo do lado deles, enquanto eu os contato também. Eles disseram que não fizeram nada ...
Portanto, a conclusão é "SEM ESPAÇOS E TABS EM ARQUIVOS DE CONFIGURAÇÃO DE DNS"