Dê uma olhada no link . O tutorial é para uma versão mais antiga do Ubuntu, mas funciona bem para 10.10 e 11.04.
A razão pela qual uma partição separada deve ser criada é porque o criador de USB só faz uma partição por padrão (sistema de arquivos FAT32). Nessa partição copia o CD ou o conteúdo ISO e cria um arquivo de persistência (ext2 formatado) chamado casper-rw. Como o FAT32 não pode conter arquivos maiores que 4 GB, o arquivo de persistência não pode ser maior que 4 GB.