Não tenho certeza de como você poderia ter chegado ao estado que descreveu, mas parece que a maneira mais sensata de recuperar seria inicializar a partir do CD de instalação do Ubuntu no modo "live ubuntu" do CD; use isso para transferir seus dados para um USB pendrive ou similar, de modo que você possa simplesmente instalar uma nova cópia do Windows e depois recuperar seus arquivos a partir do pendrive.