O Google Chrome é famoso por produzir arquivos .desktop locais (lançadores) em ~/.local/share/applications . A desvantagem é que esses arquivos .desktop não são atualizados quando o aplicativo é atualizado. Aparentemente, a atualização mais recente torna os arquivos .desktop anteriores incompatíveis.
O que fazer
Navegue até ~/.local/share/applications , localize e exclua todos os iniciadores, relacionados a Google Chrome , efetue logout e volte. Deve ser corrigido.