Como the_Seppi declarado, usar o bootrec.exe /fixboot
e /fixmbr
deve funcionar. Às vezes, o sinalizador de inicialização pode ser removido da partição para inicializar. Tente criar um USB ao vivo do GParted e procure o seguinte:
Você notará que o sinalizador de inicialização está na minha partição de inicialização 2GiB. Se você precisar adicionar o sinalizador de inicialização, reinicialize novamente no modo de recuperação do Windows e execute os comandos bootrec novamente e veja se isso funciona.