Você pode definir a frequência mínima / máxima da CPU na linha de comando para ver se ela resolve seu problema:
sudo apt-get install cpufrequtils
Para ver seus perfis de CPU:
sudo cpufreq-info
Para ver como definir valores:
sudo cpufreq-set -h
Seus problemas de superaquecimento podem indicar uma pasta térmica antiga na CPU ou poeira no sistema que bloqueia o fluxo de ar. Eu tento limpar meus laptops sempre que começo a ter problemas e removo a pasta térmica antiga e reaplico.
Pedi emprestadas as etapas cpufreq daqui: link