Não. O Windows usa "discos dinâmicos" para volumes de raid e spanning, que não são suportados no linux. Claro, se você não estiver fazendo backup de seus dados, é apenas uma questão de tempo até que você os perca, portanto, você já deve ter um método de backup. Com isso, faça backup dos seus dados e, quando você instalar o servidor Ubuntu, poderá formatar as unidades como um ataque do Linux e restaurar seus dados.