Contanto que você faça um upgrade no local usando o procedimento sugerido na WIKI. Você deveria estar bem. No entanto, como uma recomendação geral, você deve sempre fazer backup de seus dados A menos que tenha 100% de certeza de que o que estiver fazendo não vai quebrar o sistema.
Eu recomendo fazer o backup dos dados primeiro, só então tentar uma atualização. Você também pode fazer uma instalação limpa do 14.04. O backup dos dados deve ser sua primeira prioridade antes de você fazer qualquer upgrade. !!