Você pode querer formatar seu disco completo para o formato NTFS. O Windows não está muito interessado em mais nada quando se trata de instalá-lo em seu disco rígido. Com formatação completa em NTFS (com o Gparted em uma sessão de Live CD), você também está excluindo o GRUB. Você deve ser capaz de inicializar no instalador do Windows depois disso.