você deve verificar através do caminho absoluto do phpmyadmin para permissões. Minha pista é que em algum nível o servidor web não tem acesso a uma pasta e, portanto, não é capaz de executar sua interface administrativa.
você pode tentar algo como o seguinte:
chgrp -R <your webserver group (most likely www-data)> /path/to/phpmyadmin
# Add execute rights on the folders in order to
# allow the web-server to access you files
find /path/to/phpmyadmin -type d -exec chmod g+x {} +
# then, allow the web-server to read the files in the path
find /path/to/phpmyadmin -type f -exec chmod g+r {} +
Você não deve mais ter problemas depois disso.
Se o problema persistir depois disso, você deve tentar um nível de pasta menor, sem as -R flags
chgrp www-data /path/to
chmod g+x /path/to
Espero que isso ajude. Obrigado