Minha pergunta: Como faço para o Python usar minha própria versão compilada do OpenBLAS?
O guia de instalação do Theano sugere que se deve testar se os componentes da biblioteca BLAS associados estão corretamente otimizados através destes comandos :
THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=cpu python 'python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"'/misc/check_blas.py
THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=gpu python 'python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"'/misc/check_blas.py
Os resultados são:
Card: GTX 770
Results on CPU 0.62s and GPU 0.11s
Não tenho certeza se esses resultados foram bons. Eu decidi comparar diferentes bibliotecas como feito em este post . Como a computação científica requer toda a aceleração possível, isso pareceu uma boa ideia.
Para testar a versão mais recente, eu:
git clone https://github.com/xianyi/OpenBLAS.git
make TARGET=HASWELL (o TARGET não é realmente necessário, pois detecta automaticamente) make PREFIX=/opt/OpenBLAS install . /usr/lib/openblas-haswell_cstm/
sudo update-alternatives --install /usr/lib/libblas.so.3 libblas.so.3 /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 30
Infelizmente, isso gera um erro:
$ sudo update-alternatives --config libblas.so.3
There are 4 choices for the alternative libblas.so.3 (providing /usr/lib/libblas.so.3).
Selection Path Priority Status
------------------------------------------------------------
0 /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3 40 auto mode
* 1 /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3 35 manual mode
2 /usr/lib/libblas/libblas.so.3 10 manual mode
3 /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3 40 manual mode
4 /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 30 manual mode
Press enter to keep the current choice[*], or type selection number: 4
update-alternatives: using /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 to provide /usr/lib/libblas.so.3 (libblas.so.3) in manual mode
max@MaxLin:~/tutorials$ python
Python 2.7.8 (default, Oct 20 2014, 15:05:19)
[GCC 4.9.1] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 153, in <module>
from . import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 13, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 18, in <module>
from .polynomial import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/polynomial.py", line 19, in <module>
from numpy.linalg import eigvals, lstsq, inv
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/__init__.py", line 50, in <module>
from .linalg import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/linalg.py", line 29, in <module>
from numpy.linalg import lapack_lite, _umath_linalg
ImportError: /usr/lib/liblapack.so.3: undefined symbol: gotoblas
Não tenho certeza se isso tem a ver com a versão compilada não sendo um . so.3 versão . Eu tentei usar o libopenblas_haswellp-r0.2.14.so eo libopenblas.so criado pelo make , mas não tem efeito sobre o erro.
Se você quer construir um pacote Debian personalizado, eu recomendo que você comece com o pacote openblas existente e Como baixar, modificar, construir e instalar um Pacote fonte Debian? .
Você pode modificar o nome do pacote e os nomes dos arquivos da biblioteca, se achar que o pacote não substitui totalmente o fornecido.