Não é realmente uma ameaça à segurança; O ubuntu vem com o ntfs-3g por padrão, assim ele pode ler / montar partições ntfs a partir do get go. Concedido, um poderia usar sua partição linux para nuke a partição do windows, mas isso é em você, não o sistema operacional. Proteja ambos os sistemas operacionais e o problema é inexistente:)