Infelizmente, isso não é possível. Para recuperar os ícones da área de trabalho, você terá que desabilitar o plug-in Compiz Wallpaper
e permitir que o Nautilus / Files desenhe sua área de trabalho.
O plugin Compiz Wallpaper pode desenhar o seu fundo, o que pode permitir que você faça coisas legais (como ter uma imagem de fundo diferente para cada área de trabalho). Mas isso entra em conflito com a capacidade do Nautilus de desenhar a área de trabalho e apenas o Nautilus pode exibir ícones da área de trabalho.
Para mais informações, consulte as respostas a essa pergunta. Aparentemente, as pessoas tentaram fazer com que o Nautilus desenhasse uma área de trabalho transparente para que você possa ver as imagens do plugin Compiz Wallpaper atrás dos ícones do Nautilus, mas esses esforços ainda não foram bem-sucedidos.