Eu tenho o LibreOffice versão 4.4.2.2 no Xubuntu 14.04. Percebi que posso alterar a cor de fundo dos comentários para o meu gosto, se eu for para Ferramentas > Opções > LibreOffice > Dados do usuário. Lá eu me adicionaria como um proprietário com um certo nome (por exemplo, meu primeiro e último nome, apenas meu primeiro nome, etc.). Então eu fecharia e adicionaria um comentário. Cada vez que havia um novo nome, havia uma nova cor de fundo para o comentário. Eu fiz isso até me deparar com uma cor que eu gostava. Então eu fiquei com esse nome. Eu acho que as cores diferentes podem estar vindo das cores do tema Xfce que eu instalei, embora eu não tenha 100% de certeza. É muito bom se deparar com uma resposta. :)