O Windows não é bom em reconhecer outros sistemas operacionais. Se não estiver funcionando, desligue o disco completamente com sudo cat /dev/zero >/dev/sda
de um Ubuntu USB; deixe-o funcionar por alguns segundos, para sobrescrever os setores de inicialização e, em seguida, saia com -c.
O Windows verá uma unidade em branco não particionada & amp; deve ser executado. Se não, é provável que seja um problema com o seu Windows USB - funciona em outro lugar?