Abra nautilus
e vá para Preferências - > Comportamento , você encontrará suas opções.
Equivalente, lance gconf-editor
e defina o valor da chave
para launch
.
Como alternativa, crie um ativador apontando para o seu script e torne-o executável. Esta opção é melhor, porque envolve o script único e não todos os arquivos de texto executáveis.