O projeto QGIS usa o CMake, portanto, você precisa executar cmake para gerar o Makefile, seguido por make para criar o aplicativo. Com base na forma como o o Ubuntu cria o QGIS , talvez você queira executar cmake -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr -D CMAKE_SKIP_RPATH=TRUE -D BINDINGS_GLOBAL_INSTALL=TRUE -D PEDANTIC=TRUE -D WITH_SPATIALITE=TRUE -D WITH_MAPSERVER=TRUE-D QGIS_CGIBIN_SUBDIR=/usr/lib/cgi-bin .
Você também pode querer instalar as dependências de construção para o QGIS. Você pode fazer isso executando sudo apt-get build-dep qgis .