Você não apenas compilou, você deve ter instalado essas bibliotecas em todo o sistema. Você deve tentar desinstalar o que quer que tenha instalado e reinstalar os pacotes do gerenciador de pacotes.
Parece que meu Ubuntu 14.4 LTS perdeu muita funcionalidade depois da minha compilação do glib 2.0 e do mais recente Gstreamer.
Multimídia, IME, montagem automática e muitas outras funcionalidades foram perdidas desde então.
Como posso corrigir esse problema?
Você não apenas compilou, você deve ter instalado essas bibliotecas em todo o sistema. Você deve tentar desinstalar o que quer que tenha instalado e reinstalar os pacotes do gerenciador de pacotes.