Se você instalou apenas o Lyx Processor e o Tex-live, precisará estender a funcionalidade do LyX instalando os pacotes listados (em negrito) para obter funcionalidade completa. Eles estão todos disponíveis no Ubuntu Software Center.
Aqueles que são NÃO em negrito são opcionais (acho que são auto-explicativos). Quando eu instalei estes, todas as minhas classes de documentos se tornaram disponíveis.
Para classes de documentos adicionais (subclasses) e outras formas de como você pode visitar o Wiki do Lyx aqui
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chktex: verifique erros tipográficos
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dvipost: exibe as alterações controladas na saída do formato DVI
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gnuhtml2latex: importe documentos HTML
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groff: formatação de tabela aprimorada em exportações de texto simples
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librsvg2-bin, inkscape: use o formato de imagem SVG em documentos do LyX (se estiver usando o Inkscape como editor de gráficos no Lyx)
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linuxdoc-tools: exporte documentos SGML LinuxDoc
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mythes- *: use o dicionário de sinônimos do OpenOffice.org/LibreOffice
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noweb: importe arquivos noweb
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rcs: controle de versão integrado
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sgmltools-lite: exporte documentos SGML DocBook
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texlive-xetex, etoolbox: use o sistema de composição de texto XeTeX
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wv: importar documentos do MS Word