Para inicializar a partir do disco ativo: a melhor maneira é gravar uma ISO em uma unidade USB / Flash.
Para Windows: Como criar um stick USB inicializável no Windows
Para UBUNTU: Como criar um stick USB inicializável no Ubuntu .
Para restaurar o GRUB: Recuperando o Ubuntu após a instalação do Windows .
Agora, se a partição do Windows estiver em condições saudáveis, vá para: Como consertar o MBR para o Windows 7? para restaurar o GRUB de UBUNTU
OU Como remover o Linux Boot Loader da inicialização após a exclusão de partições Linux? para fazê-lo a partir do Windows. Acho que esta segunda opção é melhor porque você não usa mais o UBUNTU. Para esta segunda opção, você precisará do disco inicializável do Windows.
Se a instalação do Windows estiver corrompida, depois de restaurar a entrada do carregador de inicialização no MBR, tente reparar o Windows.
Espero que isso ajude você.