Eu não sei qual é o seu hardware e configuração do BIOS, mas você ainda pode passar pelas configurações do BIOS, verifique a Ajuda do Ubuntu no teclado USB, existem alguns passos para fazer em algumas configurações da BIOS, talvez você só precise corrigir alguns deles.
Verifique também a tabela de Layout de teclado, se você não conseguir encontrá-lo, use o terminal:
gkbd-keyboard-display -l keyboard_layout
EDIT: Verifique também o Universal Access
em Configurações do Sistema, desative Sticky Keys
Essa seria a minha melhor pista sobre a trava Ctrl.